Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H3BQV1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3BQV1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3BQV1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3BQV1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQV1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQV1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms