Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms