Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM4A7MD48 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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