Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD3A6NKT7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD3A6NKT7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms