Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms