Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC144AA2RUR9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC144AA2RUR9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms