Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SCN8AQ9UQD0 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN8AQ9UQD0 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
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