Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ZNF548Q8NEK5 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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