Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SP140Q13342 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SP140Q13342 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SP140Q13342 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SP140Q13342 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP140Q13342 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP140Q13342 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP140Q13342 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SP140Q13342 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP140Q13342 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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