Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNGA3Q16281 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNGA3Q16281 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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