Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
HOXD11P31277 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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