Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
RABGEF1Q9UJ41 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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RABGEF1Q9UJ41 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1Q9UJ41 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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