Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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TUBB3Q13509 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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TUBB3Q13509 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TUBB3Q13509 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TUBB3Q13509 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TUBB3Q13509 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TUBB3Q13509 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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