Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN4PQ13434 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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