Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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