Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PGGT1BP53609 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms