Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NKX1-1Q15270 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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