Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP1A4Q13733 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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