Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms