Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHRNEQ04844 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms