Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1Q9NPL8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1Q9NPL8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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