Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIK4Q16099 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.4 ms