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| PTPRR | Q15256 | RNU6-1338P-201 | ENST00000516328 | 91 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | RNU5B-3P-201 | ENST00000516601 | 115 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | SCARNA24.2-201 | ENST00000516968 | 130 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | IGHVII-62-1-201 | ENST00000519283 | 235 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | AC105137.2-201 | ENST00000569073 | 466 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | AC022335.1-204 | ENST00000590779 | 600 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | AC011373.1-201 | ENST00000607270 | 237 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTPRR | Q15256 | RNU5F-2P-201 | ENST00000516066 | 82 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | RPS15AP11-201 | ENST00000594193 | 385 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | AC093732.2-201 | ENST00000607950 | 274 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | ST7-AS1_1.1-201 | ENST00000611142 | 116 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | CDKN2B-AS.1-201 | ENST00000617921 | 150 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | EVI2A-201 | ENST00000247270 | 1860 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | USP45-208 | ENST00000500704 | 5826 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | ATF2-204 | ENST00000409437 | 3697 nt | TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | AF165147.1-201 | ENST00000433310 | 6103 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | ZNF204P-201 | ENST00000416749 | 2397 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | BMP5-201 | ENST00000370830 | 3952 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | DCUN1D1-208 | ENST00000632685 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | GAGE12B-201 | ENST00000361446 | 117 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | Y_RNA.20-201 | ENST00000362479 | 113 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | SNORD81.1-201 | ENST00000363064 | 77 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | RNU6-626P-201 | ENST00000363354 | 107 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPRR | Q15256 | RNU6-280P-201 | ENST00000364145 | 104 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |