Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms