Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms