Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NFIAQ12857 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NFIAQ12857 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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