Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSG2Q14126 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
DSG2Q14126 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms