Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFGEF2Q9Y6D5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms