Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms