Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD2APQ9Y5K6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD2APQ9Y5K6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms