Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF6Q9Y252 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF6Q9Y252 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms