Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRQQ9UMZ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms