Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED23Q9ULK4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED23Q9ULK4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms