Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PNMA2Q9UL42 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms