Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXD3Q9UJU5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms