Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms