Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms