Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCF2Q9UG63 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms