Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC4Q9UBN4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC4Q9UBN4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC4Q9UBN4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC4Q9UBN4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC4Q9UBN4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPC4Q9UBN4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms