Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF7Q9UBF6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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