Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms