Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TDP1Q9NUW8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDP1Q9NUW8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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