Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106BQ9NUM4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106BQ9NUM4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms