Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SERINC1Q9NRX5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms