Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC3GQ9HC16 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms