Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1DQ9H5J8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms