Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG5Q9H1Y0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG5Q9H1Y0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms