Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASXL3Q9C0F0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms