Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM4Q9C037 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms