Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN1Q9BY11 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms