Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms